Минусы: 

1. 

для обеспечения необходимым количеством биологического топлива придется использовать от четырех до тринадцати процентов всех сельскохозяйственных угодий Европы, что в свою очередь может привести, как к развитию сельскохозяйственной отрасли, так и к уменьшению объемов производства продуктов. России, придется пожертвовать еще большими сельскохозяйственными угодьями.

2. 

высокий уровень влажности биомассы и достаточно большие площади ее расположения существенно увеличивают материальные затраты на ее сбор и перевозку, так что они составляют около пятидесяти процентов стоимости самого продукта.

3. 

высокий уровень потребления энергии, необходимой для производства жидкого топлива. Для производства биоэтанола потребуется столько же энергии, сколько содержится в самом жидком топливе.